ANÁLISE MOLECULAR E METAGENÔMICA DE PAPILOMAVÍRUS ASSOCIADOS AO SARCOIDE EQUINO

Autor(es): Maria Eduarda Lucca Weber , Rafael Sartori Flores, Kétlin Milena Zardin, Maitê Braido, Nicole Amoêdo Luvison, Mariana Soares da Silva, Leandro do Monte Ribas, Leticia Dossin Regianini,
Orientador: André Felipe Streck
Quantidade de visulizações: 53

O sarcóide é uma das principais neoplasias dermatológicas dos equinos, caracterizada por comportamento biológico infiltrativo e elevada taxa de recidiva. Embora sua etiologia não esteja completamente elucidada, há forte associação com os papilomavírus (PVs), especialmente BPV1 e BPV2. Entretanto, a diversidade de PVs associada ao sarcoide equino ainda é pouco conhecida, principalmente quanto à presença de tipos virais além de BPV1 e BPV2 nas diferentes formas clínicas da doença. Os PVs apresentam genoma de DNA circular com elevada variabilidade genética, podendo influenciar sua patogenicidade e interação com o hospedeiro. O sarcoide pode manifestar-se nas formas plano/oculto, fibroblástica, mista, verrucosa, nodular e maligna.  O estudo teve como objetivo investigar, por metagenômica, a diversidade genética dos PVs associados às diferentes manifestações clínicas do sarcoide equino, visando caracterizar os vírus envolvidos na patogênese dessas lesões. Foram analisadas 55 amostras de sarcoide provenientes de 21 equinos. As amostras foram agrupadas em 8 pools de acordo com a classificação clínica das lesões (fibroblástico, misto, verrucoso e nodular) e submetidas à PCR utilizando os primers FAP59/FAP64 para detecção de PVs. Posteriormente, os pools foram submetidos ao enriquecimento pela técnica do círculo rolante (RCA) e sequenciados na plataforma Illumina MiSeq. Os reads obtidos foram processados para remoção das sequências do hospedeiro e filtrados quanto à qualidade utilizando o FastQC. As sequências remanescentes foram analisadas na plataforma CZ ID e posteriormente mapeadas contra o banco de dados do NCBI para identificação viral. Os contigs de PVs foram montados em Geneious 2026.0.2. As análises permitiram a recuperação de 4 genomas completos de papilomavírus, correspondente aos tipos  BPV2, BPV1, EcPV8 e EcPV5, além da identificação de  22 sequências parciais de L1 pertencentes a diferentes  PVs. Adicionalmente, 50% das amostras do pool misto classificado como PCR-negativas apresentaram sequências virais detectáveis por metagenômica, evidenciando limitações dos primers utilizados rotineiramente. Os resultados revelam uma ampla diversidade genética de PVs associados ao sarcoide equino, incluindo tipos virais além daqueles tradicionalmente relacionados à doença. Esses achados ampliam o conhecimento sobre a epidemiologia molecular e a patogênese do sarcoide, reforçando a importância da metagenômica na investigação da diversidade viral associada à doença.

Palavras-chave: Papillomaviridae, neoplasia, genoma